В 1268 г. ученый наконец получил разрешение вернуться в Оксфорд, где продолжил свои занятия науками.
Однако тюрьма не изменила его: он любил играть на фортепиано, по-прежнему вступал в горячие споры, позволял себе резкие нападки на невежество и порочность духовенства и монахов. В результате Бэкона обвинили в ереси и вновь заточили в тюрьму, где он провел еще 14 лет. Свободу престарелый ученый получил лишь незадолго до своей смерти.
Труды Бэкона были посвящены различным областям знаний - математике, физике, химии, биологии, медицине. В этих сочинениях он высказал целый ряд замечательных догадок, снискавших ему славу одного из гениальнейших провидцев в истории науки.
Вот что писал Бэкон о научной методологии: «Есть три источника знаний: авторитет, разум, опыт. Однако авторитет недостаточен, если у него нет разумного основания, без которого он производит не понимание, а лишь принятие на веру; и разум один не может отличить софизма от настоящего доказательства. Выше всех умозрительных знаний и искусств стоит умение производить опыты».
Анализируя научные исследования, Бэкон перечисляет четыре возможных источника ошибок: 1) вера в авторитеты, 2) сила привычки, 3) использование мнений невежественного большинства и 4) смесь невежества с претензиями на знания (последний источник ошибок, по мнению Бэкона, самый опасный). Эти мысли ученого актуальны до сих пор.
